Iwasawa ersätter Nawaf Salam, Libanons nye premiärminister.
70-årige Iwasawa har suttit i domstolen sedan 2018, och var innan dess professor i internationell rätt vid universitetet i Tokyo och ordförande för FN:s kommitté för mänskliga rättigheter.
ICJ ska inte förväxlas med Internationella brottmålsdomstolen (ICC), som också har sitt säte i Haag i Nederländerna.